Binacional había sido reincorporado a la Liga 1 a inicios de temporada gracias a una orden judicial que obligó a la FPF a incluirlo en el torneo. La decisión se sustentó en que, según el club, se vulneraron sus derechos deportivos luego de que la FPF no sancionara adecuadamente a Sport Boys por incumplimientos en 2022. No obstante, esa medida ha quedado sin efecto de forma definitiva.

En línea con el reglamento oficial del torneo, todos los partidos que Binacional disputó en el Torneo Clausura 2025 serán anulados, es decir, no tendrán validez en la tabla, ni se contarán los goles ni los puntos conseguidos por los equipos que enfrentaron al cuadro de Juliaca. Sin embargo, los partidos del Torneo Apertura se mantendrán tal como fueron disputados, por tratarse de una fase previa a la revocación judicial.

Además, todos los encuentros pendientes que el cuadro puneño debía disputar en lo que resta de la temporada serán cancelados, sin que se asignen puntos ni goles a sus rivales.

Antes de la decisión, Binacional había disputado cinco partidos en el Torneo Clausura, con un balance de 1 victoria, 2 empates y 2 derrotas. Sumaba 5 puntos y estaba en el puesto 17 de la tabla acumulada con 23 unidades. Estos fueron los partidos disputados en el Clausura:

• Fecha 2: Binacional 0-0 UTC
• Fecha 3: Cusco FC 2-0 Binacional
• Fecha 4: Binacional 2-0 Alianza Atlético
• Fecha 5: Juan Pablo II 0-0 Binacional
• Fecha 6: Binacional 1-3 Sporting Cristal

Todos estos resultados serán eliminados del registro oficial del campeonato.